संरक्षण प्रभाग निवारक संरक्षण के कार्य में सक्रिय रूप से कार्य कर रहा है। इस प्रभाग ने इंदिरा गांधी राष्ट्रीय कला केन्द्र, शिल्प संग्रहालय, राजकीय संग्रहालय, अलवर संग्रहालय, राजस्थान में भंडारण की पुनर्संरचना विषय पर आईसीसीआरओएम के साथ चार कार्यशालाएं आयोजित की हैं। अभी हाल में, संरक्षण प्रयोगशाला ने आईसीसीआरओएम के सहयोग से “री-ऑर्ग राजस्थान’’ की शुरूआत की है। राजस्थान के सरकारी संग्रहालयों के 10 क्यूरेटरों ने री-ऑर्ग विधि के कार्यान्वयन का प्रशिक्षण लिया। संरक्षण प्रभाग ने पुस्तकें एवं पाण्डुलिपियां रखने के लिए निवारक संरक्षण रणनीति भी विकसित की है।
वर्ष 2015 में संरक्षण प्रभाग ने नीदरलैंड की कल्चरल हेरिटिज एजेंसी के सहयोग से जोखिम मूल्यांकन विषय पर एक कार्यशाला का आयोजन किया था। यह प्रभाग निवारक संरक्षण के एक पहलू के रूप में जोखिम मूल्यांकन में विशेषज्ञता हासिल कर रहा है।